봄
활짝 핀 꽃과 반짝이는 새잎이 눈부신 계절이지만, 멀리 보이는 눈 덮인 알프스는 6월까지도 겨울의 한자락을 즐길 수 있게 해 줍니다. 고도에 따라 개화시기가 다른 덕분에 마츠모토에서는 다른 지역의 개화시기가 끝난 4월 초순부터 5월 초순까지도 벚꽃을 즐길 수 있습니다.
가미코치 공원은4월 중순부터 개장하며, 도시 주변의 산과 고원에서는 하이킹, 캠핑 등이 가능해집니다. 하지만 산의 날씨와 기온은 급변할 수 있으므로 이에 맞게 준비하십시오. 산속에서의 밤은 5월까지도 춥습니다.
여름
일본의 다른 지역이 무더위에 시달리고 있을 때, 마츠모토 지역, 특히 일본알프스 및 산간지역에서는 지형적 이점 덕에 선선하게 지낼 수 있습니다. 또한, 등산・하이킹, 래프팅, 사이클링, 패러글라이딩 등 다양한 야외 활동을 선택, 즐길 수 있습니다. 준비된 야외활동의 자세한 정보는 이 페이지를 참고하십시오. 노리쿠라의 고지대에서는 5~6월에 10m가 넘는 눈벽을 볼 수 있으며, 8월까지 남아있는 눈을 이용해 여름 스키를 즐기는 이들도 있습니다.
장마
마츠모토의 장마는 보통 6월 중순 경부터 약 한 달간 지속됩니다. 이 시기는 습도가 높고 갑작스러운 호우도 빈번하지만, 다행히 마츠모토는 일본에서 일조량이 가장 많은 도시 중 하나입니다. 소나기가 내렸다가도 금새 파란 하늘을 볼 수 있습니다. 장마가 끝나면 날씨가 더워지므로 온화한 기온을 즐겨 보십시오. 또한, 활짝 핀 수국 등 장마 시기에 즐길 수 있는 것들도 가득합니다.
가을
가미코치, 노리쿠라고원 및 기타 지역은 9월 하순부터 빨강, 주황, 노랑으로 물들기 시작합니다. 지대가 높지 않은 곳은 11월 초순까지도 단풍을 즐길 수 있습니다. 마츠모토에는 일본에서도 유명한 유수의 단풍명소가 있으며, 가을과 겨울의 맑은 날에는 밤하늘의 반짝이는 수많은 별과 달을 만끽할 수 있습니다.
낮과 밤의 기온 차가 급변하기 시작하며, 산의 날씨와 온도 변화가 심해지므로 이게 맞게 대비해 주십시오.
태풍 시즌
태풍은 일반적으로 8월 말에서 10월 초 사이에 발생합니다. 마츠모토는 높은 산들 덕분에 최악의 폭풍우들이 비껴가지만 강풍, 폭우, 홍수 등이 발생하기도 합니다. 태풍이 지나간 후의 맑은 공기와 청명한 하늘은 상쾌하기까지 합니다.
겨울
마츠모토의 겨울은 길지만 겨울철에 즐길 수 있는 것들로 가득합니다. 따뜻한 온천에 몸을 담그고 편안한 쉼을 누리는 것부터 시 외곽 탐험까지, 추운 시기이기 때문에 할 수 있는 많은 것들이 있습니다.
매년 장소에 따라 다르기는 하지만 11월부터 4월까지 눈이 오며 스키리조트는 12월부터 4월까지 운영합니다.
마츠모토 시내에 눈이 쌓이지 않아도 일부 산 위의 도로들은 많은 눈으로 인해 폐쇄되기도 합니다. 일부 지역은 대중교통수단으로도 갈 수가 없습니다. 따뜻하게 입으시고 미끄럼 방지를 위한 신발용 장비들도 준비하십시오.